Le PAO est l’un des principaux clubs de football athéniens. Il se veut d’ailleurs le rassembleur de tous les habitants de la capitale grecque, son nom signifie « panathénien » (pan = tout, Athinaikós = athénien).
Le Panathinaïkós FC était la section amateur du Panathinaïkós Athlitikós Ómilos (Παναθηναϊκός Αθλητικός Όμιλος, « Club athlétique panathénien »). C’est en 1979 que la section est devenue professionnelle et indépendante